本发明具体提供了一种高稳定性的注射用达托霉素组合物,所述组合物由达托霉素和药学上可接受的载体组成,其中,所述的药学上可接受的载体含有二价金属盐和pH调节剂,组合物中达托霉素:二价金属盐的摩尔比为1:1.0‑1:3.5,任选地,所述的药学上可接受载体中含有渗透压调节剂。本发明注射用达托霉素显著提高了制剂的稳定性,便于制剂的室温保存和运输,保障用药安全性;并且本发明制备方法具有绿色环保、适宜产业化等优点。